Markelov a fost ucis după ce tocmai denunţase în cursul unei conferinţe de presă eliberarea anticipată a ex-colonelului rus Iuri Budanov, condamnat la 10 ani închisoare în 2003 pentru că strangulase în urmă cu trei ani o cecenă de 18 ani, Elza Kungaieva. El era avocatul familiei tinerei asasinate.
„Anchetatorii studiază diferitele motive ale asasinatului, inclusiv activitatea profesională a victimei”, a indicat comitetul de anchetă al parchetului rus într-un comunicat.
Stanislav Markelov primise anterior ameninţări prin SMS. I se cerea să renunţe la cazul Budanov, altfel va fi ucis, a dezvăluit anchetatorilor tatăl Elzei, Vissa Kungaiev.
Când a fost ucis, Markelov era însoţit de o ziaristă stagiară de la Novaia Gazeta, publicaţie care denunţă abuzurile comise de armata rusă în timpul celor două războaie în Cecenia şi la care a lucrat şi Anna Politkovskaia, cunoscuta ziaristă de investigaţii specializată în această regiune şi asasinată în octombrie 2006.
Tânăra publicistă Anastasia Baburova, în vârstă de 25 de ani, a murit după câteva ore de la atac, fiind lovită în cap de agresori. „Medicii au făcut tot ce le-a stat în putere pentru a o salva. În urmă cu câteva minute ziarista de la Novaia Gazeta Anastasia Baburova a decedat”, a indicat ziarul pe site-ul său Internet. Ea scrisese mai multe articole despre problemele rasiale şi despre ultranaţionalismul din Rusia.
Stanislav Markelov o apărase pe Anna Politkovskaia în mai multe procese, precum şi pe Mihail Beketov, ziarist din opoziţia rusă, agresat cu sălbăticie la Khimki, o periferie a Moscovei, în noiembrie 2008. El a mai fost avocatul lui Magometsalih Masaiev, un cecen declarat dispărut în august 2008, după ce îl acuzase pe preşedintele cecen Ramzan Kadârov că l-ar fi ţinut ostatic patru luni.